گروه پاتوبیولوژی همزمان با تاسیس دانشکده بهداشت در سال ۱۳۴۵ به عنوان یکی از گروه‌های مطرح و محوری دانشگاه علوم پزشکی تهران فعالیت های علمی و پژوهشی خود را در زمینه‌های میکرب شناسی، ایمنی شناسی و ویروس شناسی آغاز نمود و پس از پیروزی انقلاب اسلامی دوره های کارشناسی ارشد و دکترای تخصصی در رشته های فوق را دائر نمود. اساتید گروه علاوه بر آموزش دوره های فوق به دانشجویان رشته‌های انگل شناسی، قارچ شناسی پزشکی، ایمنی و بهداشت مواد غذایی، بیوشیمی و تغذیه و دوره MPH نیز دروس ایمنی شناسی و میکرب شناسی را تدریس می‌نمایند. گروه پاتوبیولوژی دارای 12 عضو هیات علمی در مرتبه های بالا و 14 کارمند زبده است و تا کنون موفق به انجام دهها پروژه ملی و بین المللی و آموزش به بیش از 600 دانش آموخته پردیده است. همچنین در حال حاضر بیش از 60 دانشجوی ایرانی و بین المللی دارد.
در دهه اخیر با توجه به فعالیت های وسیع در حوزه ویروس شناسی در سطح بین الملل گروه آموزشی مستقلی به همین نام در دانشکده تشکیل شده و امور آموزشی رشته مقطع های ویروس شناسی به آن گروه محول گردیده است. در حال حاضر گروه پاتوبیولوژی شامل دو بخش ایمونولوژی و میکرب شناسی و در سه رشته در مقاطع کارشناسی ارشد (ایمونولوژی، میکرب شناسی پزشکی و میکرب شناسی مواد غذایی) و دکترا (ایمونولوژی و باکتری شناسی پزشکی) دانش آموخته دارد و عمدتا در زمینه بیماریهای واگیر و غیر واگیر و واکسیناسیون به آموزش و پژوهش اشتغال دارد. طرحهای تحقیقاتی گروه پاتوبیولوژی سلامت محور و عمدتا مرتبط با بهداشت عمومی و برخوردار از نظریه های پیشگیری و کنترل بیماریهای مسری، سرطان و ... است. با گسترش حرکت در جهت دانشگاه نسل چهارم، طرحهای متعدد فناورنه و با هدف ساخت کیتهای تجاری در این گروه مصوب گردیده است و برخی از محصولات گروه پاتوبیولوژی به عنوان پتنت بین المللی ثبت گردیده اند، در حال حاضر گروه پاتوبیولوژی رتبه دوم طرحهای مرتبط با صنعت را در دانشکده اخذ نموده است.
علاوه بر فعالیتهای آموزشی و پژوهشی، گروه پاتوبیولوژی دو آزمایشگاه همکار وزارت بهداشت را در دهه گذشته راه اندازی نموده است.آزمایشگاه همکار طغیان های میکربی و اخیرا آزمایشگاه جامع کنترل میکربی جهت ارزیابی مواد و محلول ها و دستگاههای آنتی میکروبیال تاسیس و توسط سازمان غذا و دارو مورد تایید قرارگرفت.

ماموریت بخش ایمنی شناسی:

1. آموزش دانشجویان تحصیلات تکمیلی کارشناسی ارشد و دکتری تخصصی ایمنی شناسی در زمینه تحقیقات کاربردی و میدانی مرتبط با چشم انداز گروه
2. طراحی و مطالعه پیش بالینی واکسن بیماریهای عفونی، بویژه بیماریهای ویروسی
3. ارزیابی و مطالعه ایمنی زایی و مصونیت بخشی واکسن های بیماریهای عفونی تحت پوشش وزارت بهداشت (EPI)
4. مطالعه ایمونوپاتوژنز بیماریهای عفونی و بویژه عفونت های ویروسی
5. طراحی، تحقیق و توسعه تشخیص سرولوژیک بیماریهای عفونی از طریق تولید آنتی بادیهای منوکلونال و پلی کلونال
6. شناسایی و کشف بیومارکرهای نوین تشخیصی و درمانی سرطان از طریق مهندسی ژنتیک و تولید پروتئین های نوترکیب و آنتی بادیهای درمانی
7. تحقیقات پایه و کاربردی در تشخیص علل بیماریهای مرتبط با ناباروری و سقط جنین و درمان آنها با روشهای ایمونوتراپی و سلولهای بنیادی
8. بررسی اثر ریزمغذیها و مکمل های غذایی بر عملکرد سیستم ایمنی
9. مطالعه آلرژنهای بومی

ماموریت بخش میکروب شناسی:

1. آموزش دانشجویان تحصیلات تکمیلی کارشناسی ارشد میکروب شناسی پزشکی و میکروب شناسی مواد غذایی  و دکتری تخصصی باکتری شناسی پزشکی در زمینه تحقیقات کاربردی و میدانی مرتبط با چشم انداز گروه
2. تدوین برنامه های مانیتورینگ، غربالگری میدانی و پایش عفونتهای باکتریایی و همچنین پیشگیری از آلودگی های میکروبی مواد غذایی موجود در جامعه 
3. تدوین برنامه و ارایه راه کارهای بهداشتی جهت پیشگیری و کنترل عفونت های  ناشی از پاتوژن های باکتریایی 
4. شناسایی طغیان های منتقله از آب و غذا و ارائه نقشه راه پیشگیری از بروز آنها
5. شناسایی تهدیدات آلودگی های میکروبی محیطی و همکاری در تدوین چگونگی مواجه با مخاطرات آنها
6. طراحی و مطالعه پیش بالینی واکسن های عفونت های باکتریایی و تحقیق و توسعه در زمینه تولید کیتهای تشخیصی و واکسن های بیماریهای باکتریال نو ظهور
7. فراهم آوری برنامه کنترل مقاومت میکروب ها یا پیشگیری از بروز یا انتقال مقاومت با تدوین و ارائه راهکارهای مبتنی بر شواهد

چشم انداز بخش ایمنی شناسی:

با توجه به جایگاه بهداشت در نظام سلامت و نقش آن در پیشگیری و درمان بیماری‌ها، بخش ایمنی شناسی دانشکده بهداشت چشم انداز کارهای تحقیقاتی و آموزشی خود را از بدو تاسیس در ابداع یا ارتقاء روش های تشخیصی، پیشگیری  و درمانی بیماریهای واگیر و غیر واگیر مرتبط با بهداشت از منظر ایمونولوژیک متمرکز نموده است. در این راستا، ماموریت بخش ایمنی شناسی دانشکده بهداشت انجام تحقیقات کاربردی و میدانی مرتبط با چشم انداز گروه از طریق راهکارها و استراتژی های زیر می باشد.

چشم انداز بخش میکروب شناسی:

مطابق نظر سازمان جهانی بهداشت، عفونت های باکتریایی نقش مهمی بر بهداشت عمومی دارند، چرا که  اینگونه عفونت ها می توانند علاوه بر انتقال از شخصی به شخص دیگر، از طریق آب، غذا، هوا و ناقلین زنده نیز منتقل و بهداشت عمومی جامعه را به صورت منفی متاثر نمایند. با این دیدگاه، چشم انداز بخش میکروب شناسی گروه پاتوبیولوژی تحقیقات کاربردی و میدانی به منظور کنترل و پیشگیری از بیماریهای عفونی باکتریایی و ارتقا سطح بهداشت جامعه می باشد.