از ابتدای تأسیس دانشکده بهداشت در تیرماه سال 1345 تا اوایل سال 1360 کلیه امور مربوط به آموزش، پژوهش و اداری مالی دانشکده توسط یک معاونت به انجام می رسید و در این مدت اداره امور آموزش و خدمات دانشجویی، مسؤولیت رسیدگی به امور آموزش دانشجویان در همه مقاطع تحصیلی اعم از برنامه‌ریزی آموزشی و خدمات رفاهی را به عهده داشت. از اوایل سال 1360، با تفکیک معاونت‌های دانشکده، معاونت آموزش دانشکده بعنوان یکی از ارکان اصلی دانشکده شروع به کار کرد. در سال‌های اخیر، ادغام دانشکده و بین‌الملل، منجر به رشد بی‌سابقه تعداد MD-MPH و MPH ابوریحان با دانشکده بهداشت، افزایش پذیرش دانشجو در دوره‌های تحصیلات تکمیلی، پذیرش دانشجوی دوره دانشجویان شاغل به تحصیل در این دانشکده شده است. معاونت آموزشی دانشکده بهداشت با وجود تعداد زیاد دانشجو و حجم بالای کارهای مربوطه با استفاده از پرسنل ورزیده و دلسوز توانسته است تا حد زیادی انتظارات را برآورده ساخته و موجبات جلب نظر ارباب رجوع را فراهم آورد. این معاونت در سال‌های اخیر علی‌رغم رشد کمی دانشجویان با همکاری گروه‌های آموزشی توانسته است رشته‌های متعدد و جدیدی را در مقاطع مختلف در این دانشکده راه اندازی کند که از جمله آن‌ها می‌توان به رشته‌های سیاست‌گذاری سلامت، اقتصاد بهداشت، سلامت در بلایا و فوریت‌ها، بهداشت و ایمنی موادغذایی در مقطع دکتری، رشته‌های ارزیابی فن‌آوری سلامت، میکروب‌شناسی موادغذایی، بهداشت و ایمنی موادغذایی و ارگونومی در مقطع کارشناسی ارشد و رشته‌های مهندسی بهداشت محیط و مهندسی بهداشت حرفه‌ای در مقطع کارشناسی پیوسته و گرایش‌های متعدد در دوره MPH پودمانی اشاره کرد.
رسیدگی به کلیه امور آموزشی دانشجویان در مقاطع مختلف تحصیلی و جذب و ارتقای اعضای هیئت علمی دانشکده بهداشت
ارتقای کیفیت فرآیندها و ارایه خدمات آموزشی
